Portál:Otázky z biochemie (1. LF, VL)

Obsah 1 I. Základy fyzikální, bioanorganické a bioorganické chemie 2 II. Základy metabolismu 3 III. Základy biochemie orgánu a funkcí 4 IV. Základy buněčné a molekulární biologie

upravit I. Základy fyzikální, bioanorganické a bioorganické chemie

1. Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti, význam v organismu
2. Disperzní soustavy, rozpustnost látek, pravé a koloidní roztoky, difuse, osmosa, osmotický a onkotický tlak, dialysa, příklady z biochemie
3. Energetika chemických reakcí, Gibbsova energie a entropie, aplikace na metabolické děje.
4. Kinetika a energetika následných a vratných reakcí, chemická rovnováha, Guldberguv–Waageuv zákon, aplikace v enzymologii
5. Inhibice enzymových reakcí
6. Katalyzátory a biokatalyzátory, význam v biochemických dějích
7. Elektrolytická disociace, disociační konstanta, silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie
8. Brönstedova teorie kyselin a zásad, rovnováha v protolytických reakcích, příklady z biochemie. Iontový součin vody, pH a jeho význam v medicíně
9. Amfolyty, jejich vlastnosti, příklady z biochemie
10. Pufry, výpočet pH, význam v organismu
11. Oxidace a redukce, oxidoredukční potenciál, závislost na koncentraci reaktantu a na pH, příklady z biochemie
12. Srážecí reakce, součin rozpustnosti, tvorba komplexu, příklady a jejich význam v biochemii a medicíně
13. Chemické vlastnosti hlavních biogenních prvku
14. Kyslík a jeho reaktivní formy
15. Biologicky a toxikologicky významné prvky periodického systému mimo základních biogenních prvků
16. Biologický a metabolický význam stopových prvků
17. Struktura organických sloučenin, izomerie, příklady z metabolických drah
18. Halogen- a nitroderiváty uhlovodíku, příklady toxikologicky a lékařsky významných sloučenin
19. Sirné deriváty uhlovodíku, příklady lékařsky významných sloučenin
20. Aminy, význam v biochemii
21. Alkoholy, fenoly, aldehydy a ketony, uplatnění v metabolismu
22. Karboxylové kyseliny, funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii
23. Dusíkaté, kyslíkaté a sirné heterocykly, význam
24. Strukturní charakteristiky aminokyselin, dělení, reakce význam, peptidy, peptidová vazba,příklady biologicky významných peptidů
25. Bílkoviny, struktura, vlastnosti a funkce
26. Sacharidy, rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam
27. Reakce a deriváty monosacharidu, disacharidy, O- a N- glykosidová vazba, příklady
28. Homopolysacharidy a heteropolysacharidy, struktura, výskyt a význam v organismu
29. Proteoglykany, glykoproteiny, struktura, vlastnosti, příklady
30. Lipidy, definice, klasifikace, struktura, vlastnosti, funkce v organismu
31. Fosfolipidy a sfingolipidy, struktura, vlastnosti a význam
32. Steroly, žlučové kyseliny a steroidní hormony, struktura, funkce a význam v organismu

upravit II. Základy metabolismu

1. Struktura enzymu (kofaktory, koenzymy, oligomerní struktura); mnohočetné enzymové formy a isoenzymy. Využití enzymologie v medicíně
2. Enzymová aktivita, fyzikálně chemické vlivy, regulace (exprese, allosterické vlivy, kovalentní modifikace).
3. Dýchací řetězec. Oxidativní fosforylace
4. Makroergní sloučeniny, fosforylace na substrátové úrovni, pohon endergonních reakcí
5. Citrátový cyklus, amfibolický charakter, průběh, regulace
6. Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, deaminace, transaminace, dusíková bilance
7. Tvorba amoniaku, jeho detoxikace, ureosyntetický cyklus a jeho regulace, hyperamonémie
8. Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin skupiny pyruvátu, oxalacetátu, 2-oxoglutarátu, sukcinyl CoA, s rozvětveným řetězcem, zapojení aminokyselin do metabolických procesů
9. Metabolismus aromatických aminokyselin, poruchy
10. Metabolismus sirných aminokyselin
11. Biosyntéza, biodegradace a funkce nejdůležitějších biogenních aminů
12. Konverze aminokyselin do specializovaných produktu (kreatin, jeho přeměny a význam, S-adenosylmethionin a jeho význam)
13. Glykolysa, regulace
14. Glukoneogenese, regulace
15. Syntéza a degradace a glykogenu, regulace, poruchy
16. Pentosový cyklus, regulace
17. Metabolismus galaktosy a fruktosy, poruchy
18. Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu
19. Biosyntéza mastných kyselin
20. Tvorba ketolátek z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam
21. Karnitinový systém, oxidace mastných kyselin, energetický výtežek
22. Triacylglyceroly, biosyntéza, degradace
23. Biosyntéza fosfolipidu a sfingolipidu
24. Syntéza a degradace eikosanoidů, cyklooxygenasová a lipoxygenásová cesta.
25. Biosyntéza cholesterolu a její regulace, úloha HMG-CoA reduktasy, transport endogenního a exogenního cholesterolu
26. Přeměna a vylučování cholesterolu, žlučové kyseliny
27. Biosyntéza a degradace steroidních hormonů
28. Transport lipidů, úlohy lipoproteinu, struktura lipoproteinové částice (vznik, přeměna a úloha chylomiker, VLDL, LDL a HDL lipoproteinu)
29. Biosyntéza tetrapyrrolu – hemu a její poruchy
30. Degradace tetrapyrrolu a její poruchy
31. Metabolismus pyrimidinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy
32. Metabolismus purinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy

upravit III. Základy biochemie orgánu a funkcí

1. Regulace a koordinace metabolismu sacharidů a ostatních živin
2. Glykémie, regulace, diagnostika (oGTT, glykovaný hemoglobin)
3. Metabolismus tukové tkáně
4. Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou, metabolismus železa
5. Hormonální regulace vodního a minerálního metabolismu
6. Regulace kostního metabolismu
7. Hormonální regulace energetického metabolismu
8. Biochemické pochody pri trávení živin
9. Biochemické funkce hepatocytu a jater, možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytu a jaterních funkcí
10. Biotransformace endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesů, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí
11. Ústojné systémy organismu, funkce a význam pro acidobazickou rovnováhu
12. Metabolismus erythrocytů
13. Hemokoagulace, kaskáda koagulačních faktorů, úloha trombocytu
14. Moč – fysiologické a patologické součásti.
15. Kolagen – struktura, vlastnosti, metabolismus.
16. Biochemie pojiva (chrupavka, kost)
17. Biochemie kuže. Biochemický výklad hmatu.
18. Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny
19. Biochemie vidění, Waldův cyklus, transducinový cyklus
20. Biochemie smyslu (sluch, chuť, čich)
21. Biochemie nervových synapsí; neurotransmitery.
22. Steroidní hormony a jejich funkce v regulačních dějích
23. Peptidové hormony a jejich funkce v endokrinních regulačních dějích
24. Lokální mediátory, cytokiny
25. Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích
26. Molekulární základy humorální imunitní odpovědi
27. Molekulární základy buněčné imunitní odpovědi
28. Vitaminy rozpustné v tucích
29. Vitaminy rozpustné ve vodě
30. Struktura, složení a vlastnosti buněčných membrán
31. Transport látek přes membrány
32. Kompartmentace biochemických procesů na úrovni buňky

upravit IV. Základy buněčné a molekulární biologie

1. Membránové receptory a jejich ligandy, G-proteiny
2. Typy a úloha druhých poslů v přenosu signálu
3. Signálně transdukční kaskády cytokinu a rustových faktorů
4. Aktivace fosfolipas a signalizace využívající deriváty lipidů
5. Signalizace NO. Přehled signálních cest a význam
6. Intracelulární receptory a jejich ligandy, HSP, interakce intracelulárních receptoru s DNA
7. Vzájemná komunikace signálně transdukčních drah
8. Struktura a funkce DNA
9. Struktura a funkce RNA
10. Organizace prokaryontního, eukaryontního a mitochondriálního genomu
11. Replikace eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace
12. Reparace DNA
13. Transkripce eukaryontní genomové DNA
14. mRNA, struktura, syntéza, posttranskripční úpravy
15. Metabolismus RNA a RNA interference
16. Regulace genové exprese na úrovni transkripce
17. Genetický kód a jeho vlastnosti
18. Eukaryontní, prokaryontní a mitochondriální translace a její regulace
19. Posttranslační úpravy proteinu.Třídění a transport proteinu, úpravy a třídění proteinu v Golgiho aparátu. Biosyntéza glykoproteinu.
20. Restrikční enzymy a jejich využití, úpravy DNA a konstrukce rekombinantních molekul. Klonování DNA
21. DNA diagnostika, techniky (RFLP,hybridizace)
22. Metody frakcionace buňky, elektroforéza nukleových kyselin a proteinu
23. Polymerasová řetězová reakce, uplatnění PCR v klinické diagnostice, RT-PCR a využití této techniky, techniky sekvenování DNA
24. Povaha genových mutací, mutace dědičné a získané, polymorfismy, mini- a mikrosatelitové markery, metody detekce
25. Retroviry a pararetroviry, struktura a replikace
26. DNA a RNA viry, replikace
27. Úloha protoonkogenu a tumor supresorových genů
28. Buněčný cyklus, úloha komplexu cyklinu a cdks
29. Regulace buněčného cyklu, úloha tumor supresorových genů
30. Ubikvitinace a proteasomální degradace proteinu
31. Biochemie apoptosy
32. Epigenetika, modifikace histonu, metylace DNA, význam