Diskuse s uživatelem:Formol/Archiv

Z WikiSkript

kategorizace preparátů[upravit | editovat zdroj]

Ahoj, dnes nad ránem jsem překategorizovával spoustu histopatologických preparátů tak, aby náležely do Kategorie:Histopatologické preparáty. Myslím, že mezi nimi bylo i pár tvých příspěvků. Mohl bys další preparáty, co budeš nahrávat, dávat do této kategorie? Bude to přehlednější, doteď byla část nekategorizovaná nebo jen v kategorii "Patologie". Díky,
Zef avatar 3.jpg Zef 19.5.2014, 12:44
Ahoj, nevidím v tom nejmenší problém - tedy až na to, že mi ani žádná z dárkonosných nadpřirozených bytostí ani ředitel v dohledné době nevěnují scanner na sklíčka nebo alespoň fotografický nástavec na mikroskop, takže těch preparátů zase až tak moc nebude.
Jaromír Šrámek (diskuse) 19.5.2014, 13:00

cs.wiki[upravit | editovat zdroj]

Ahoj,

chci se jen ze zvědavosti zeptat, jesli jsi dříve editoval českou wiki pod nickem Formol nebo jestli to je jen pouhá shoda jmen.

S pozdravem.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 19.7.2014, 05:57
Ahoj, ano, editoval - a díky tomu jsem ztratil v "malé" Wikipedie důvěru.
Jaromír Šrámek (diskuse) 20.7.2014, 20:25

Nový infobox[upravit | editovat zdroj]

Dobrý den pane doktore, chci s Hattrich začít vytvářet další infobox po vzoru bakterií, ale než se do toho pustíme, rádi bychom váš názor ohledně jeho budoucího obsahu, ať jej pak nemusíme předělávat. Přemýšlíme o infoboxu "Nádor". Byli bychom rádi, kdybyste nám doporučil parametry, které by takový infobox měl obsahovat (zodpovědný onkogen/tumor-supresor gen? nejč. lokalizace? makroskopický vzhled?) nebo kdybyste navrhl, jestli je vhodné takový infoboxy vůbec tvořit, jestli třeba není větší poptávka po jiném, třeba obecnějším typu infoboxu (frekventnější typ článku). Díky za konzultaci.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 28.12.2014, 10:22
Přeji hezký den, pane kolego.

Poptávku po infoboxech nejsem schopen posoudit, předpokládám ale, že bych je využil. Technický problém je, že řada položek by měla spíše charakter výčtu než jedné položky - a to se týče i příslušné klíčové mutace nebo dokonce i obecněji postižené signalizační kaskády. Myslím si, že by neměly chybět následující položky:

  • kód MKN
  • kód MKN-O (vícenásobné, lze dělat linky po vzoru např. en.wiki)
  • lokalizace (vícenásobné, případně vč. četnosti)
  • prevalence/incidence/...
  • maximum výskytu (věk, pohlaví,..)
  • prognóza (někdy jsou literární údaje pouze sumární, jindy podle klinických stádií; obvykle pětileté přežití, někdy střední doba života nebo desetileté přežití)
  • klíčová mutace (vícenásobné)
  • postižená signalizační kaskáda (vícenásobné)
  • histologický typ (vícenásobné, případně vč. četnosti)
  • výskyt nádoru jako součást syndromů (vícenásobné)

Ke zvážení by mohly být i parametry:

  • klíčové imunohistochemické markery (vícenásobné, někdy je diagnosticky významná i negativita)
  • klíčové molekulární markery (dtto)
  • terapeutické modality (ale k tomu by se měl vyjádřit onkolog)

Jaromír Šrámek (diskuse) 29.12.2014, 06:46
Díky, až bude koncept hotov, předáme k recenzi.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 29.12.2014, 14:11
Ještě mě napadlo obšlehnout z anglické Wikipedie šablonu MKNO, možná by bylo dobré ji zmínit v dokumentaci k infoboxu.
Jaromír Šrámek (diskuse) 30.12.2014, 13:00
Díky, využil jsem. Můžete se podívat na aktuální příklad infoboxu na Šablona:Infobox - nádor/dokumentace? Díky.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 30.12.2014, 20:50
Mohl byste dát odkaz na tu originál MKNO šablonu? Když jsem se jí snažil dát do Šablona:Infobox - nádor, tak to neprošlo...
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 1.1.2015, 23:20
Zdravím, infobox vypadá dobře. Problém není v šabloně (originál) ale v tom, že progenetix.net vyžaduje i kód biologického chování a nejde o úplnou databázi, zrovna Brennerův tumor v ní není. Pokusím se zapátrat na webu po lepší databázi a šablonu upravit.
Jaromír Šrámek (diskuse) 2.1.2015, 06:32
Tak seznam - a dokonce informačně hutnější - je na webu IARC, ale na jednotlivé položky se, bohužel, odkazuje nejspíše interními pořadovými čísly. Udělat převodní tabulku by nebyl zase až takový problém, jen by to byla práce pro vraha a ve wikikódu by byla dosti nepřehledná, manuální vkládání odkazu by bylo pro změnu dosti nepohodlné...
Jaromír Šrámek (diskuse) 2.1.2015, 06:58
Taky to mohli odkazovat místo vlastních pořadových čísel přímo těmi kódy... Pohledáme ještě další databázi nebo zkusíme ten převod udělat?
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 2.1.2015, 08:27
Jinou databázi jsem nenalezl. Nejschůdnější by bylo asi doplnit další parametr, přímý link na podstránku na webu IARC s příslušným kódem. Sice to bude dosti obtěžující při vyplňováni šablony, ale těch kódů jsou zhruba dva tisíce, navíc bez jednoduchého přepočtu ICD-O=>číslo stránky, tedy nezáživní práce nejméně na několik dní...
Jaromír Šrámek (diskuse) 2.1.2015, 12:54
Souhlas. Ale tímpádem postrádá smysl ta šablona MKNO, ne?
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 2.1.2015, 13:01
Ano, tím pádem postrádá smysl.
Jaromír Šrámek (diskuse) 2.1.2015, 13:06
Dobře, díky, upravím dokumentaci k infoboxu, ještěže ho nemáme ve spoustě článků... Kdyby vás napadlo ještě nějaké vylepšení nebo byste narazil na databázi, kt. bychom mohli využít, tak dejte vědět.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 2.1.2015, 13:08

Pozvánka na 18. WV[upravit | editovat zdroj]

Dobrý den pane doktore, pokud budete mít čas a chuť, tak jste srdečně zván k účasti na 18. WikiVíkend.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 23.2.2015, 07:53

Šablona MKNO[upravit | editovat zdroj]

Dobrý den pane doktore,

pokusil jsem se na základě vámi autorované chybně vyplněné parametry šablony OMIM vytvořit obdobnou . Nedaří se mi ale zprovoznit ji do provozuschopného stavu, nejspíš mi haprují závorky. Záměr šablony bude jasný z dokumentace. Tu dokumentaci samozřejmě můžete dle libosti přeformulovat.

Byl byste ochoten se na ní podívat a opravit ji? Děkuji.
Zef avatar 3.jpg Zef d|p 15.11.2015, 08:19
Dobrý den, tak se koukám, že dr. Vejražka už tu šablonu zprovoznil. Přesto děkuji za důvěru:-)
Jaromír Šrámek (diskuse) 16.11.2015, 15:32