Procvičování:Příklady z lékařské genetiky/Molekulární genetika

1

Uvedený fragment DNA obsahuje začátek sekvence pro proteosyntézu. Určete, zda se jedná o fragment z kódujícího či antikódujícího vlákna: 5´ TGGCTGAAGCGTCTTGCGCATACGC 3´

	kódující vlákno
	antikódující vlákno

2

Uvedený fragment DNA obsahuje začátek sekvence pro proteosyntézu. Určete, zda se jedná o fragment z kódujícího či antikódujícího vlákna: 5´ GGCACTCTTGCGATGACAGTAAAGTCG 3´

	kódující vlákno
	antikódující vlákno

V kódujícím řetězci DNA došlo k záměně guaninu za cytosin v pozici 10 od 5´ konce fragmentu. Sekvence DNA před mutací: 5´ GGCACTCTTGCGATGACA 3´

3

Určete typ mutace na úrovni DNA (označte správnou možnost)

	delece
	inzerce
	tranzice
	transverze

4

Posuďte účinek mutace na úrovni proteinu (označte správnou možnost)

Tabulka genetického kódu k úlohám 4, 6, 8 a 10

	missense
	samesense
	nonsense
	frameshift

V kódujícím řetězci DNA došlo k odstranění dvou nukleotidů v pozici 8-9 od 5´ konce fragmentu. Sekvence DNA před mutací: 5´ TGGCAGAAGCGTCTTGCGCATCC 3´

5

Určete typ mutace na úrovni DNA (označte správnou možnost)

	delece
	inzerce
	tranzice
	transverze

6

Posuďte účinek mutace na úrovni proteinu (označte správnou možnost)

	missense
	samesense
	nonsense
	frameshift

V kódujícím řetězci DNA došlo k záměně thyminu za adenin v pozici 6 od 5´ konce fragmentu. Sekvence DNA před mutací: 5´ GGCACTCTTGCGATGACA 3´

7

Určete typ mutace na úrovni DNA (označte správnou možnost)

	delece
	inzerce
	tranzice
	transverze

8

Posuďte účinek mutace na úrovni proteinu (označte správnou možnost)

	missense
	samesense
	nonsense
	frameshift

V kódujícím řetězci DNA došlo k vložení thyminu za nukleotid v pozici 6 od 5´ konce fragmentu. Sekvence DNA před mutací: 5´ TGGCAG🢃AGCGTCTTGCGCATCC 3´

9

Určete typ mutace na úrovni DNA (označte správnou možnost)

	delece
	inzerce
	tranzice
	transverze

10

Posuďte účinek mutace na úrovni proteinu (označte správnou možnost)

	missense
	samesense
	nonsense
	frameshift

11

V rodině, kde je první dítě (proband) postiženo cystickou fibrózou, byla provedena přímá DNA diagnostika k identifikaci dvou častých mutací v genu CFTR. Jako první byla detekována nejčastější mutace - delece kodonu způsobující chybění fenylalaninu v pozici 508 proteinu CFTR.

Druhou metodou bylo vyšetření mutace způsobující ztrátu restrikčního místa pro restrikční enzym X, který normální alelu o délce 120 bp stěpí na fragmenty 65 a 55 bp.
Na základě analýzy rodokmenu a výsledků přímé DNA diagnostiky určete genotyp:

Rodina 1

Genotyp zdravého sourozence probanda II/2:

Genotyp dosud nenarozeného sourozence II/3:

12

V rodině, kde je první dítě (proband) postiženo cystickou fibrózou, byla provedena přímá DNA diagnostika k identifikaci dvou častých mutací v genu CFTR. Jako první byla detekována nejčastější mutace - delece kodonu způsobující chybění fenylalaninu v pozici 508 proteinu CFTR. Druhou metodou bylo vyšetření mutace způsobující vznik restrikčního místa pro restrikční enzym Y, který mutovanou alelu stěpí na fragmenty 60 a 48 bp (normální alela má délku 108 bp).
Na základě analýzy rodokmenu a výsledků přímá DNA diagnostiky určete genotyp:

Rodina 2

Genotyp zdravého sourozence probanda II/2:

Genotyp dosud nenarozeného sourozence II/3:

13

V rodině s výskytem familiární adenomatózní polypózy (AD) byla provedena nepřímá presymptomatická DNA diagnostika osob v riziku, s použitím intragenového polymorfizmu v délce tandemových repetic.
Kteří dosud zdraví jedinci z druhé a třetí generace nesou familiární mutaci v genu APC?:

Rodina 3

	II/4
	III/1
	III/2
	III/3

14

V rodině s výskytem fenylketonurie u prvního dítěte byla provedena nepřímá prenatální DNA diagnostika metodou detekce RFLP s použitím intragenového polymorfizmu.

Rodina 4

Jaká je pravděpodobnost, že je plod postižen? (Výsledek vyjádřete v procentech.) %

Jaký je genotyp zdravého sourozence II/2?

15

V rodině s výskytem fenylketonurie u prvního dítěte byla provedena nepřímá prenatální DNA diagnostika metodou detekce RFLP s použitím intragenového polymorfizmu.

Rodina 5

Jaká je pravděpodobnost, že je plod postižen? (Výsledek vyjádřete v procentech.) %

Jaký je genotyp zdravého sourozence II/2?

16

V rodině s výskytem fenylketonurie u prvního dítěte byla provedena nepřímá prenatální DNA diagnostika metodou detekce RFLP s použitím intragenového polymorfizmu.

Rodina 6

Jaká je pravděpodobnost, že je plod postižen? (Výsledek vyjádřete v procentech). %

17

V rodině s výskytem hemofilie A byla provedena nepřímá prenatální DNA diagnostika s využitím polymorfního lokusu ve vzdálenosti 3,3 cM od genu. Tento lokus má v populaci dvě různé alely.

Plod III/2 je mužského pohlaví – s jakou pravděpodobností bude postižen hemofilií? (Výsledek vyjádřete v procentech).  %

Jaká je pravděpodobnost, že II/2 je přenašečka?  %

Jaká je pravděpodobnost, že III/1 je přenašečka?  %

18

U plodu byl prenatální diagnostikou zjištěn Edwardsův syndrom. Použita byla metoda QF-PCR využívající STR polymorfismus na chromosomu 18.
U kterého z rodičů a v kterém meiotickém dělení došlo k nondisjunkci?
(Pokud je více správných odpovědí, uveďte všechny.)

Rodina 1	Rodina 2	Rodina 3
			I. meiotické dělení u otce
			II. meiotické dělení u otce
			I. meiotické dělení u matky
			II. meiotické dělení u matky

19

U plodu byl prenatální diagnostikou zjištěn Turnerův syndrom. Použita byla metoda QF-PCR využívající STR polymorfismus na chromosomu X.
U kterého z rodičů a v kterém meiotickém dělení došlo k nondisjunkci?
(Pokud je více správných odpovědí, uveďte všechny.)

Rodina 4	Rodina 5	Rodina 6
			I. meiotické dělení u otce
			II. meiotické dělení u otce
			I. meiotické dělení u matky
			II. meiotické dělení u matky

20

U plodu byl prenatální diagnostikou zjištěn Klinefelterův syndrom. Použita byla metoda QF-PCR využívající STR polymorfismus na chromosomu X.
U kterého z rodičů a v kterém meiotickém dělení došlo k nondisjunkci?
(Pokud je více správných odpovědí, uveďte všechny.)

Rodina 7	Rodina 8	Rodina 9
			I. meiotické dělení u otce
			II. meiotické dělení u otce
			I. meiotické dělení u matky
			II. meiotické dělení u matky

Zdroj

• Příklady byly převzaty z prezentací MUDr. Romany Mihalové se souhlasem autorky.