Portál:R wiki

     R wiki

Portál R wiki je věnován programovacímu jazyku R a jeho užití v biomedicíně. Důraz zde klademe na jednoduché a postupné seznamování s jazykem od úplných základů. Pokročilejším uživatelům je určena rozšířená a podrobnější verze portálu, kde lze najít další zdroje ke studiu.

Úvod

R je programovací jazyk, obecněji prostředí, vhodný zejména pro statistické výpočty a jejich grafické výstupy. Možnosti jeho použití jsou však mnohem širší. Je to svobodný software uvolněný pod licencí GNU a o jeho rozvoj se stará početná komunita.

• Úvod:
  • Proč bych se měl právě já učit R
• Co potřebuji pro začátek:
  • Nainstalovat jazyk R do počítače
• Aplikace, kde můžu pohodlně programovat:
  • RStudio (zdarma, volitelné – teoreticky stačí prostředí R nainstalované výše)
  • Základy práce v RStudiu (užitečný základ R i pro uživatele, kteří si RStudio nenainstalují a budou používat jednoduchou konzoli R)
  • R commander (další grafické uživatelské rozhraní pro jazyk R)
• Co se může taky hodit:
  • Pandoc („švýcarský armádní nůž“ pro převod dokumentů mezi značkovacími jazyky, mimo jiné i wiki)
  • MiKTex (program usnadňující tvorbu dokumentů v TeX/LaTex)
  • Notepad++ (textový editor)

Šablona portálu pro tvorbu boxů

Parametry šablony

Tato šablona upřednostňuje parametry formátované v bloku.

Parametr		Popis	Typ	Stav
barva	barva	prázdné	Neznámý	nepovinný
písmo	písmo	prázdné	Neznámý	nepovinný
nadpis	nadpis	prázdné	Neznámý	nepovinný
sloupce	sloupce	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	obsah	prázdné	Neznámý	nepovinný
velikost	velikost	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	1 obsah	Obsah	Neznámý	nepovinný

Základy jazyka R

•  Úvodní lekce
  • Základy jazyka R (výpis textu na obrazovku, základní aritmetické operace, komentáře, nastavení pracovní složky)
• Základní stavební prvky jazyka R
  • Datové typy (numerická hodnota, celé číslo, komplexní číslo, logická hodnota, textový řetězec, NA, NULL, NaN)
  • Datové struktury (vektor, faktor, matice, pole, tabulky dat, seznam)
• Matematika nad datovými strukturami
  • Matematické operace
• Základy programování v R
  • Podmínky a cykly
  • Funkce
• Tvorba grafických výstupů
  • Diagramy v R
  • R Markdown
  • Shiny aplikace

Šablona portálu pro tvorbu boxů

Parametry šablony

Tato šablona upřednostňuje parametry formátované v bloku.

Parametr		Popis	Typ	Stav
barva	barva	prázdné	Neznámý	nepovinný
písmo	písmo	prázdné	Neznámý	nepovinný
nadpis	nadpis	prázdné	Neznámý	nepovinný
sloupce	sloupce	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	obsah	prázdné	Neznámý	nepovinný
velikost	velikost	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	1 obsah	Obsah	Neznámý	nepovinný

Základy statistiky v R

Cílem této sekce je poskytnout základní kuchařku (cookbook) použití jazyka R ve statistických výpočtech.

• Popisná statistika v R
• Explorační analýza dat v R
• Pravděpodobnost v R

Šablona portálu pro tvorbu boxů

Parametry šablony

Tato šablona upřednostňuje parametry formátované v bloku.

Parametr		Popis	Typ	Stav
barva	barva	prázdné	Neznámý	nepovinný
písmo	písmo	prázdné	Neznámý	nepovinný
nadpis	nadpis	prázdné	Neznámý	nepovinný
sloupce	sloupce	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	obsah	prázdné	Neznámý	nepovinný
velikost	velikost	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	1 obsah	Obsah	Neznámý	nepovinný

Příklady a tutoriály

•  Pro začátečníky
  • Základy
  • Vektory
  • Matice
  • Faktory
  • Datové tabulky
  • Seznamy
• Pro pokročilé
  • Import a export dat
  • Export dat do MS Excelu
  • Matice - příklad č.1
  • Matice - příklad č.2

Šablona portálu pro tvorbu boxů

Parametry šablony

Tato šablona upřednostňuje parametry formátované v bloku.

Parametr		Popis	Typ	Stav
barva	barva	prázdné	Neznámý	nepovinný
písmo	písmo	prázdné	Neznámý	nepovinný
nadpis	nadpis	prázdné	Neznámý	nepovinný
sloupce	sloupce	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	obsah	prázdné	Neznámý	nepovinný
velikost	velikost	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	1 obsah	Obsah	Neznámý	nepovinný

Externí odkazy

• R pro začátečníky na webu Code Horizons.com
• R Tutorial na webu w3schools.com
• Seminář Lubomíra Štěpánka „Úvod do jazyka R“
• Volitelný předmět Úvod do skriptovacího jazyka R (v SISu pod kódem B03128)
• Tutoriály na Datacamp
• Web R Markdownu
• E-learningová učebnice Matematická biologie (analýza dat, statistika, R, modelování)
  • Základy R pro biology
• R Bootcamp webový kurz na téma Tidyverse

Šablona portálu pro tvorbu boxů

Parametry šablony

Tato šablona upřednostňuje parametry formátované v bloku.

Parametr		Popis	Typ	Stav
barva	barva	prázdné	Neznámý	nepovinný
písmo	písmo	prázdné	Neznámý	nepovinný
nadpis	nadpis	prázdné	Neznámý	nepovinný
sloupce	sloupce	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	obsah	prázdné	Neznámý	nepovinný
velikost	velikost	prázdné	Neznámý	nepovinný
obsah	1 obsah	Obsah	Neznámý	nepovinný