Názvosloví enzymů (FBLT)

Z WikiSkript

Triviální názvosloví

Původně užívaný termín fermenty, který vycházel z faktu, že enzymy se podílejí na fermentaci (kvašení), se již nepoužívá. Enzymy objevené mezi prvními dostaly obvykle jméno podle svého zdroje nebo metody, kterou byly objeveny. Jejich názvy tedy bývají bez vztahu k mechanismu reakce, kterou katalyzují. Mnohé jsou zakončeny příponou -in – viz pepsin objevený v trávicí šťávě žaludku (řec. pepsis – trávení) nebo ptyalin nalezený ve slinách (řec. ptyalon – slina).

Doporučené názvosloví[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Zavádí do názvosloví systém a je zároveň jednodušší než systematické názvosloví, proto je často užíváme v běžné praxi. Název vytvoříme spojením:

  1. Substrát + -áza (-asa) – například amyláza (katalyzující hydrolýzu amylózy);
  2. Typ reakce + -áza – například dehydrogenáza.

Systematické názvosloví[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Systematické názvosloví zavedla IUB (International Union of Biochemistry). Každý enzym má své EC (Enzyme Commission) číslo složené ze čtyř číslic – x.x.x.x. První značí jednu z šesti hlavních enzymových tříd, další dvě podskupinu a podpodskupinu. Poslední indikuje pořadí enzymu v podpodskupině (a zcela tak daný enzym charakterizuje). Rozeznáváme těchto šest hlavních tříd enzymů:

  1. oxidoreduktázy,
  2. transferázy,
  3. hydrolázy,
  4. lyázy (syntázy),
  5. izomerázy,
  6. ligázy (syntetázy).

Oxidoreduktázy[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Oxidoreduktázy katalyzují reakce, při nichž dochází k oxidaci jedné a k redukci druhé složky. Často využívají kofaktory – např. NAD+, NADP+, FAD či hem. Mezi oxidoreduktázy patří:

  • oxidázy, peroxidázy,
  • oxygenázy – vnášejí do molekuly substrátu kyslík, buď ve formě -OH (monooxygenázy, nebo také hydroxylázy) či jako O2 (dioxygenázy),
  • dehydrogenázy – oxidují substrát odebráním H-atomů, jejich název se zkracuje jako DH (př. laktátdehydrogenáza – LDH, alkoholdehydrogenáza – ADH),
  • desaturázy.

Transferázy[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Transferázy se podílejí na přenosu různých skupin (amino-, acyl-, methyl-, glykosyl-, fosforyl-, …). Příkladem transferáz jsou:

  • transaminázy (aminotransferázy) – přenášejí -NH2 skupinu,
  • kinázy (fosfotransferázy) – přenášejí fosfátovou skupinu z ATP nebo jiných nukleosidtrifosfátů,
  • transaldolázy, transketolázy.

Hydrolázy[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Katalyzují hydrolytické reakce (štěpení vazeb v molekulách prostřednictvím molekuly vody). Mezi hydrolázy patří:

  • lipázy, fosfolipázy,
  • proteázy, peptidázy (pepsin, trypsin),
  • esterázy,
  • fosfatázy.

Lyázy (syntázy)[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Katalyzují odstranění určité skupiny ze substrátu bez hydrolýzy (nehydrolytické štěpení např. vazeb mezi C-C, C-N) a také adiční reakce na dvojnou vazbu a syntézy bez spotřeby ATP. Příkladem lyáz jsou:

  • dekarboxylázy,
  • aldolázy,
  • dehydratázy, hydratázy.

Izomerázy[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Katalyzují změny uvnitř jedné molekuly substrátu (intramolekulární změny). Vzniklý produkt je izomerem výchozího substrátu. Mezi izomerázy patří:

  • epimerázy – mění polohu -OH skupiny v molekule,
  • mutázy – mění polohu fosfátové skupiny v molekule.

Ligázy (syntetázy)[✎ upravit | ☲ editovat zdroj]

Katalyzují syntetické reakce spojené s hydrolýzou ATP (spřažení exergonické a endergonické reakce). Příkladem ligáz jsou:

  • karboxylázy,
  • DNA-ligáza.