Portál:Otázky z biochemie (1. LF UK, VL)

Z WikiSkript


I. Základy fyzikální, anorganické a organické chemie[upravit | editovat zdroj]

  1. Chemická vazba (kovalentní a koordinačně kovalentní), iontová vazba, slabé interakce a hydrofobní exkluze a jejich vlastnosti.
  2. Voda a její fyzikální a chemické vlastnosti, význam v organismu.
  3. Disperzní soustavy – rozdělení, příklady z biochemie. Rozpustnost látek.
  4. Difuze, osmóza, osmotický a onkotický tlak, dialýza, příklady z biochemie.
  5. Energetika chemických reakcí, Gibbsova energie a entropie, aplikace na metabolické děje.
  6. Chemická rovnováha, Guldbergův-Waageův zákon. Kinetika a energetika vratných reakcí, aplikace v enzymologii.
  7. Základní metody pro separaci makromolekul (elektroforéza, chromatografie, hmotnostní spektrometrie) a jejich využití v klinické praxi.
  8. Spektrofotometrie, princip a využití v klinické biochemii.
  9. Elektrolytická disociace, disociační konstanta, silné a slabé elektrolyty, příklady z biochemie.
  10. Brønstedova teorie kyselin a zásad, rovnováha v protolytických reakcích, příklady z biochemie. Iontový součin vody, pH a jeho význam v medicíně.
  11. Amfolyty, jejich vlastnosti, příklady z biochemie.
  12. Pufry, výpočet pH, význam v organismu.
  13. Oxidace a redukce, rovnováha v redoxních reakcích, oxidoredukční potenciál, závislost na koncentraci složek reakce (Nernstova rovnice). Příklady z biochemie.
  14. Srážecí reakce, součin rozpustnosti, tvorba komplexu, koordinační sloučeniny, příklady. Význam v biochemii a medicíně.
  15. Chemické vlastnosti makrobiogenních prvků (C, H, O, N, P, Na, K, Ca, Mg, S, Cl).
  16. Kyslík a jeho anorganické sloučeniny, reaktivita, vlastnosti.
  17. Příklady mechanismů působení toxikologicky významných prvků a anorganických sloučenin (např. těžké kovy, chlór, CO, kyanidy).
  18. Biologický a metabolický význam mikrobiogenních a stopových prvků (Fe, Zn, Cu, I, Se, Co, Mn).
  19. Struktura organických sloučenin, typy izomerií, příklady.
  20. Aminy a nitroderiváty uhlovodíků, příklady a význam v biochemii.
  21. Halogenderiváty a sirné deriváty (thioly, sulfonové kyseliny) uhlovodíků. Příklady a význam v biochemii a v medicíně.
  22. Alkoholy, fenoly, aldehydy a ketony, uplatnění v metabolismu.
  23. Karboxylové kyseliny, funkční a substituční deriváty karboxylových kyselin, uplatnění v biochemii.
  24. Příklady biochemicky významných heterocyklů (např. pyrimidin, pyridin, pyrrol, purin, furan, pyran, indol, thiofen), jejich význam, vlastnosti, biochemický význam heteroatomu v cyklu.
  25. Strukturní charakteristiky aminokyselin, dělení, reakce, význam.
  26. Peptidy, peptidová vazba, příklady biologicky významných peptidů.
  27. Bílkoviny, struktura primární, sekundární, terciární, kvartérní. Suprasekundární struktury, proteinové domény. Poruchy sbalování proteinů. Vlastnosti a funkce bílkovin.
  28. Sacharidy, rozdělení, struktura, stereochemie, biologický význam.
  29. Reakce a deriváty monosacharidů, disacharidy, O- a N- glykosidová vazba, příklady.
  30. Homopolysacharidy a heteropolysacharidy, struktura, výskyt a význam v organismu.
  31. Proteoglykany, glykoproteiny, struktura, vlastnosti, příklady.
  32. Lipidy − klasifikace, struktura, vlastnosti, biologický význam.
  33. Mastné kyseliny – klasifikace, struktura, vlastnosti, biologický význam.
  34. Fosfolipidy a sfingolipidy – klasifikace, struktura, vlastnosti, biologický význam.
  35. Steroly, žlučové kyseliny a steroidní hormony, struktura, funkce a význam v organismu.

II. Základy metabolismu[upravit | editovat zdroj]

  1. Struktura enzymů, bílkovinné a nebílkovinné součásti. Monomerní enzymy a enzymy složené z více podjednotek. Izoenzymy. Klasifikace a nomenklatura enzymů.
  2. Kofaktory, koenzymy a prostetické skupiny. Aktivátory a koaktivátory enzymů. Příklady, biologický význam.
  3. Regulace enzymové aktivity, význam pro řízení metabolických dějů, příklady. Fyzikálně-chemické faktory, alosterické vlivy. Principy měření enzymové aktivity, význam v medicíně.
  4. Mechanismus a energetika enzymové katalýzy. Kinetika enzymových reakcí.
  5. Inhibice enzymů: kompetitivní, nekompetitivní, kovalentní, alosterická. Využití enzymových inhibitorů v medicíně.
  6. Dýchací řetězec. Oxidační fosforylace. Člunky pro transport elektronů přes mitochondriální membrány.
  7. Tzv. „makroergní“ sloučeniny, fosforylace na substrátové úrovni, pohon endergonních reakcí.
  8. Citrátový cyklus, amfibolický charakter, průběh, regulace.
  9. Obecné mechanismy přeměny aminokyselin, deaminace, transaminace, dekarboxylace.
  10. Tvorba a detoxikace amoniaku, ureosyntetický cyklus, jeho regulace a poruchy. Dusíková bilance.
  11. Metabolismus aminokyselin skupiny pyruvátu a oxalacetátu, zapojení těchto aminokyselin do metabolických procesů.
  12. Metabolismus uhlíkového skeletu aminokyselin skupiny 2-oxoglutarátu, aminokyselin s rozvětveným řetězcem, zapojení těchto aminokyselin do metabolických procesů.
  13. Metabolismus aromatických aminokyselin, poruchy
  14. Metabolismus sirných aminokyselin
  15. Biosyntéza, biodegradace a funkce nejdůležitějších biogenních aminů
  16. Konverze aminokyselin do specializovaných produktů. Kreatin. S-adenosylmethionin
  17. Glykolýza, regulace
  18. Glukoneogeneze, regulace
  19. Syntéza a degradace glykogenu, regulace, poruchy
  20. Pentózový cyklus, regulace
  21. Metabolismus galaktózy, poruchy, Metabolismus fruktózy, poruchy
  22. Metabolismus kyseliny glukuronové a její význam v organismu
  23. Biosyntéza mastných kyselin
  24. Tvorba ketolátek z acetyl-CoA, metabolické příčiny, význam
  25. Oxidace mastných kyselin, energetický výtěžek, karnitinový systém
  26. Triacylglyceroly, biosyntéza, degradace
  27. Biosyntéza a odbourávání fosfolipidů a sfingolipidů
  28. Syntéza a degradace eikosanoidů, cyklooxygenázová a lipoxygenázová cesta
  29. Biosyntéza cholesterolu a její regulace, úloha HMG-CoA reduktázy, transport endogenního a exogenního cholesterolu
  30. Přeměna a vylučování cholesterolu, žlučové kyseliny
  31. Biosyntéza a degradace steroidních hormonů
  32. Transport lipidů, úlohy lipoproteinů, struktura lipoproteinové částice (vznik, přeměna a úloha chylomiker, VLDL, LDL a HDL lipoproteinů). Elektroforéza lipoproteinů
  33. Biosyntéza a degradace tetrapyrrolů - hemu, poruchy biosyntézy, poruchy degradace
  34. Významné proteiny krevní plazmy, význam v organismu (albumin, Ig, komplement, proteiny akutní fáze, transportní proteiny)
  35. Metabolismus pyrimidinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy
  36. Metabolismus purinových nukleotidů, regulace, inhibitory, poruchy


III. Základy biochemie orgánu a funkcí[upravit | editovat zdroj]

  1. Regulace a koordinace metabolismu sacharidů a ostatních živin
  2. Glykémie, regulace, diagnostika (oGTT, glykovaný hemoglobin)
  3. Metabolismus tukové tkáně
  4. Regulace biosyntézy hemu, rozdíly mezi hepatocytem a erythroidní buňkou, metabolismus železa
  5. Hormonální regulace vodního a minerálního metabolismu
  6. Hormonální regulace energetického metabolismu
  7. Biochemické pochody při trávení živin
  8. Biochemické funkce hepatocytu a jater, možnosti biochemické diagnostiky poškození hepatocytu a jaterních funkcí
  9. Biotransformace endogenních a exogenních látek, typy biotransformačních procesů, toxické a kancerogenní látky v životním prostředí
  10. Pufrové systémy organismu, funkce a význam pro acidobazickou rovnováhu
  11. Metabolismus erytrocytů
  12. Hemokoagulace, kaskáda koagulačních faktorů, úloha trombocytu
  13. Moč – fyziologické a patologické součásti.
  14. Kolagen – struktura, vlastnosti, metabolismus.
  15. Biochemie pojiva (chrupavka, kost)
  16. Biochemie kůže. Biochemický výklad hmatu.
  17. Kontraktilní aparát, řízení kontrakce hladké a kosterní svaloviny
  18. Markery poškození svalové tkáně, význam, stanovení
  19. Biochemie vidění, Waldův cyklus, transducinový cyklus
  20. Biochemie smyslů (sluch, chuť, čich)
  21. Biochemie nervových synapsí; neurotransmitery.
  22. Katecholaminy - biosynthesa, biodegradace
  23. Steroidní hormony
  24. Peptidové hormony a jejich funkce v endokrinních regulačních dějích
  25. Lokální mediátory, cytokiny
  26. Hormony štítné žlázy a jejich funkce v regulačních dějích
  27. Molekulární základy humorální imunitní odpovědi – Struktura a funkce jednotlivých částí imunoglobulinů, třídy imunoglobulinů. Molekulární podstata diverzity imunoglobulinů
  28. Molekulární základy buněčné imunity – Rozpoznání patogenu, efektorové mechanismy, MHC molekuly, struktura a funkce, mechanismus prezentace antigenů TC a TH lymfocytům.
  29. Základní imunochemické metody. Imunoturbidimetrie, ELISA, RIA
  30. Vitaminy rozpustné v tucích
  31. Vitaminy rozpustné ve vodě
  32. Struktura, složení a vlastnosti buněčných membrán
  33. Transport látek přes membrány
  34. Kompartmentace biochemických procesů na úrovni buňky


IV. Základy buněčné a molekulární biologie[upravit | editovat zdroj]

  1. Základní principy buněčné signalizace
  2. Membránové receptory a jejich ligandy, G-proteiny
  3. Typy a úloha druhých poslů v přenosu signálu
  4. Signálně transdukční kaskády cytokinů a růstových faktorů
  5. Aktivace fosfolipas a signalizace využívající deriváty lipidů
  6. Signalizace NO, Přehled signálních cest a význam
  7. Intracelulární receptory a jejich ligandy, heat-shock protein, interakce intracelulárních receptorů s DNA
  8. Amplifikace, integrace a vzájemná komunikace („cross-talk“) signálních drah
  9. Struktura nukleových kyselin
  10. Organizace prokaryontního, eukaryontního a mitochondriálního genomu
  11. Struktura lidského genomu. Techniky sekvenování DNA. Projekty sekvenování lidského genomu
  12. Replikace eukaryontní DNA, replikační aparát a jeho regulace
  13. Reparace DNA
  14. Transkripce eukaryontní genomové DNA Struktura mRNA, posttranskripční úpravy. Metabolismus RNA. Transkripční faktory, vazba DNA-protein
  15. Metabolismus RNA a RNA interference
  16. Regulace genové exprese na úrovni transkripce
  17. Genetický kód a jeho vlastnosti
  18. Eukaryontní, prokaryontní a mitochondriální translace a její regulace
  19. Regulace translace
  20. Posttranslační úpravy proteinu.Třídění a transport proteinu, úpravy a třídění proteinu v Golgiho aparátu. Biosyntéza glykoproteinů
  21. Vezikulární transport. Endocytóza a exocytóza
  22. Restrikční enzymy a jejich využití, úpravy DNA a konstrukce rekombinantních molekul. Klonování DNA
  23. DNA diagnostika, techniky (RFLP, hybridizace)
  24. Metody frakcionace buňky, elektroforéza nukleových kyselin a proteinu
  25. Polymerasová řetězová reakce, uplatnění PCR v klinické diagnostice, RT-PCR a využití této techniky, techniky sekvenování DNA
  26. Povaha genových mutací, mutace dědičné a získané, polymorfismy, mini- a mikrosatelitové markery, metody detekce
  27. DNA a RNA viry, replikace
  28. Úloha protoonkogenu a tumor supresorových genů
  29. Buněčný cyklus, úloha komplexu cyklinu a cdks
  30. Regulace buněčného cyklu, úloha tumor supresorových genů
  31. Ubikvitinace a proteasomální degradace proteinu
  32. Biochemie apoptosy
  33. Epigenetika a její význam, Modifikace histonů, Metylace DNA, význam